Извините, регистрация закрыта. Возможно, на событие уже зарегистрировалось слишком много человек, либо истек срок регистрации. Подробности Вы можете узнать у организаторов события.
Темой биоинформатической секции школы будет трехмерная структура ДНК. Молекула ДНК из одной клетки, растянутая в длину, составит более двух метров, а при этом она упакована в ядро диаметром несоклько микрон. От упаковки ДНК зависит работа генов. В последнее время появились экспериментальные методы, позволяющие изучать структуру хроматина (ДНК и взаимодейтвующих с ней белков) в масштабе всей клетки. На школе будут рассмотрены как теоретические задачи (моделирование структуры ДНК с точки зрения физики полимеров), так и задачи анализа данных о структуре ДНК и ее функциональном состоянии. Вводные лекции будут включать необходимое введение в молекулярную биологию, обзор экспериментальных методов и получаемых при их помощи данных, а также обзор текущих представлений о структуре и функции хроматина. Умение программировать полезно, но не является абсолютно необходимым.
Заявки принимаются до 01.08.2017. Обучение проводится на русском языке.
Андрей Миронов: РНК и хроматин
Екатерина Храмеева: Анализ данных по пространственной структуре хроматина
Михаил Тамм: Состояния полимеров
Александр Чертович: Моделирование хроматина
Сергей Ульянов. Топология генома в единичных клетках
Сергей Ульянов. Связь эволюции генома и пространственной организации
Михаил Тамм: Топологические ограничения в полимерных системах
Михаил Тамм: Динамика полимеров и динамика хроматина
Александр Чертович: Топологические ограничения в полимерных системах – по Гросбергу
Александр Чертович: Альтернативные модели организации хроматина – по Мирному
Сергей Нечаев: Статистика узлов
Работа над задачами:
(1) Александр Горский. Про поиск кластеров в сетях в терминах спектра матриц контактов
(2) Александр Чертович. Составить VMD-файл с трехмерной структурой хроматина по заданной двухмерной карте контактов (реальной или искусственно приготовленной)
(3) Анатолий Рубинов, Михаил Гельфанд. Запрограммировать алгоритм выделения ТАДов, придуманный Анатолием Рувимовичем.