• 25 августа 2017, пятница
  • Москва, Нобеля 3

Летняя школа Сколтеха по биоинформатике

Регистрация на событие закрыта

Извините, регистрация закрыта. Возможно, на событие уже зарегистрировалось слишком много человек, либо истек срок регистрации. Подробности Вы можете узнать у организаторов события.

Другие события организатора

2408 дней назад
с 0:00 25 августа до 0:00 4 сентября 2017
Москва
Нобеля 3

Темой биоинформатической секции школы будет трехмерная структура ДНК. Молекула ДНК из одной клетки, растянутая в длину, составит более двух метров, а при этом она упакована в ядро диаметром несоклько микрон. От упаковки ДНК зависит работа генов. В последнее время появились экспериментальные методы, позволяющие изучать структуру хроматина (ДНК и взаимодейтвующих с ней белков) в масштабе всей клетки. На школе будут рассмотрены как теоретические задачи (моделирование структуры ДНК с точки зрения физики полимеров), так и задачи анализа данных о структуре ДНК и ее функциональном состоянии. Вводные лекции будут включать необходимое введение в молекулярную биологию, обзор экспериментальных методов и получаемых при их помощи данных, а также обзор текущих представлений о структуре и функции хроматина. Умение программировать полезно, но не является абсолютно необходимым.

Заявки принимаются до 01.08.2017. Обучение проводится на русском языке.

 

Андрей Миронов: РНК и хроматин

Екатерина Храмеева: Анализ данных по пространственной структуре хроматина

Михаил Тамм: Состояния полимеров

Александр Чертович: Моделирование хроматина

Сергей Ульянов. Топология генома в единичных клетках

Сергей Ульянов. Связь эволюции генома и пространственной организации

Михаил Тамм: Топологические ограничения в полимерных системах

Михаил Тамм: Динамика полимеров и динамика хроматина

Александр Чертович: Топологические ограничения в полимерных системах – по Гросбергу

Александр Чертович: Альтернативные модели организации хроматина – по Мирному

Сергей Нечаев: Статистика узлов 


Работа над задачами:


(1) Александр Горский. Про поиск кластеров в сетях в терминах спектра матриц контактов
(2) Александр Чертович. Составить  VMD-файл с трехмерной структурой хроматина по заданной двухмерной карте контактов (реальной или искусственно приготовленной)
(3) Анатолий Рубинов, Михаил Гельфанд. Запрограммировать алгоритм выделения ТАДов, придуманный Анатолием Рувимовичем.

Регистрация

Рекомендуемые события

Организуете события? Обратите внимание на TimePad!

Профессиональная билетная система, статистика продаж 24/7, выгрузка списков участников, встроенные инструменты продвижения, личный кабинет для самостоятельного управления и еще много чего интересного.

Узнать больше